Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LINC01547P58512 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
LINC01547P58512 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
LINC01547P58512 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms