Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SNX16P57768 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX16P57768 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SNX16P57768 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SNX16P57768 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX16P57768 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX16P57768 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX16P57768 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX16P57768 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX16P57768 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX16P57768 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SNX16P57768 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX16P57768 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX16P57768 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX16P57768 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX16P57768 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX16P57768 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX16P57768 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SNX16P57768 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX16P57768 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX16P57768 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX16P57768 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX16P57768 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX16P57768 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX16P57768 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SNX16P57768 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SNX16P57768 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SNX16P57768 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX16P57768 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX16P57768 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX16P57768 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX16P57768 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SNX16P57768 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX16P57768 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX16P57768 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SNX16P57768 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SNX16P57768 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SNX16P57768 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SNX16P57768 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX16P57768 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX16P57768 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX16P57768 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX16P57768 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX16P57768 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SNX16P57768 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX16P57768 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX16P57768 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX16P57768 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SNX16P57768 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms