Protein–RNA interactions for Protein: P57682

KLF3, Krueppel-like factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF3P57682 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
KLF3P57682 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
KLF3P57682 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
KLF3P57682 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF3P57682 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF3P57682 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF3P57682 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF3P57682 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF3P57682 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
KLF3P57682 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF3P57682 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF3P57682 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF3P57682 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF3P57682 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF3P57682 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
KLF3P57682 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
KLF3P57682 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF3P57682 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF3P57682 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF3P57682 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF3P57682 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF3P57682 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF3P57682 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
KLF3P57682 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF3P57682 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF3P57682 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF3P57682 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF3P57682 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF3P57682 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
KLF3P57682 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF3P57682 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF3P57682 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF3P57682 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
KLF3P57682 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
KLF3P57682 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
KLF3P57682 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF3P57682 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
KLF3P57682 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
KLF3P57682 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
KLF3P57682 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms