Protein–RNA interactions for Protein: P57678

GEMIN4, Gem-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMIN4P57678 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GEMIN4P57678 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GEMIN4P57678 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GEMIN4P57678 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GEMIN4P57678 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GEMIN4P57678 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.3 ms