Protein–RNA interactions for Protein: P57055

RIPPLY3, Protein ripply3, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY3P57055 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
RIPPLY3P57055 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
RIPPLY3P57055 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
RIPPLY3P57055 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 431.6 ms