Protein–RNA interactions for Protein: P56199

ITGA1, Integrin alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA1P56199 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ITGA1P56199 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA1P56199 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA1P56199 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms