Protein–RNA interactions for Protein: P55344

LIM2, Lens fiber membrane intrinsic protein, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIM2P55344 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIM2P55344 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
LIM2P55344 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIM2P55344 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIM2P55344 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
LIM2P55344 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIM2P55344 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIM2P55344 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIM2P55344 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
LIM2P55344 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
LIM2P55344 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
LIM2P55344 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIM2P55344 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
LIM2P55344 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIM2P55344 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
LIM2P55344 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIM2P55344 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIM2P55344 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIM2P55344 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIM2P55344 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
LIM2P55344 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIM2P55344 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIM2P55344 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
LIM2P55344 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
LIM2P55344 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
LIM2P55344 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
LIM2P55344 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
LIM2P55344 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms