Protein–RNA interactions for Protein: P55082

MFAP3, Microfibril-associated glycoprotein 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFAP3P55082 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MFAP3P55082 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MFAP3P55082 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
MFAP3P55082 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
MFAP3P55082 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
MFAP3P55082 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
MFAP3P55082 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MFAP3P55082 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms