Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
EPHA4P54764 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
EPHA4P54764 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
EPHA4P54764 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms