Protein–RNA interactions for Protein: P54760

EPHB4, Ephrin type-B receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 987 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB4P54760 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB4P54760 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB4P54760 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB4P54760 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB4P54760 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EPHB4P54760 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB4P54760 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EPHB4P54760 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EPHB4P54760 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
EPHB4P54760 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
EPHB4P54760 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms