Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PMS2P54278 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P54278 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P54278 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P54278 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P54278 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PMS2P54278 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PMS2P54278 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PMS2P54278 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PMS2P54278 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P54278 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P54278 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P54278 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P54278 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P54278 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PMS2P54278 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PMS2P54278 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P54278 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P54278 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P54278 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P54278 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P54278 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P54278 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PMS2P54278 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P54278 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PMS2P54278 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PMS2P54278 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P54278 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P54278 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P54278 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P54278 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P54278 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PMS2P54278 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PMS2P54278 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms