Protein–RNA interactions for Protein: P54107

CRISP1, Cysteine-rich secretory protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRISP1P54107 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
CRISP1P54107 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CRISP1P54107 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CRISP1P54107 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms