Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CAPZA1P52907 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
CAPZA1P52907 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CAPZA1P52907 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms