Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GTF2A1P52655 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GTF2A1P52655 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GTF2A1P52655 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms