Protein–RNA interactions for Protein: P51679

CCR4, C-C chemokine receptor type 4, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCR4P51679 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCR4P51679 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCR4P51679 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCR4P51679 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCR4P51679 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCR4P51679 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCR4P51679 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCR4P51679 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCR4P51679 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCR4P51679 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCR4P51679 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCR4P51679 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCR4P51679 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCR4P51679 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCR4P51679 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCR4P51679 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCR4P51679 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCR4P51679 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CCR4P51679 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCR4P51679 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCR4P51679 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCR4P51679 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR4P51679 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR4P51679 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR4P51679 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCR4P51679 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR4P51679 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR4P51679 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR4P51679 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR4P51679 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR4P51679 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CCR4P51679 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR4P51679 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR4P51679 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR4P51679 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CCR4P51679 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
CCR4P51679 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCR4P51679 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CCR4P51679 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102 ms