Protein–RNA interactions for Protein: P50213

IDH3A, Isocitrate dehydrogenase [NAD] subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IDH3AP50213 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
IDH3AP50213 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
IDH3AP50213 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
IDH3AP50213 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
IDH3AP50213 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms