Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PSEN1P49768 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PSEN1P49768 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PSEN1P49768 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms