Protein–RNA interactions for Protein: P49757

NUMB, Protein numb homolog, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUMBP49757 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NUMBP49757 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NUMBP49757 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBP49757 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBP49757 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBP49757 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBP49757 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NUMBP49757 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBP49757 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NUMBP49757 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUMBP49757 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NUMBP49757 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBP49757 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBP49757 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBP49757 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBP49757 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBP49757 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBP49757 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NUMBP49757 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBP49757 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBP49757 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBP49757 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBP49757 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBP49757 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NUMBP49757 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBP49757 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBP49757 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBP49757 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBP49757 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBP49757 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NUMBP49757 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBP49757 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBP49757 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBP49757 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBP49757 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NUMBP49757 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NUMBP49757 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NUMBP49757 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NUMBP49757 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NUMBP49757 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NUMBP49757 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUMBP49757 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUMBP49757 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUMBP49757 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUMBP49757 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUMBP49757 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms