Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PRIM1P49642 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PRIM1P49642 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PRIM1P49642 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC30.84■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
PRIM1P49642 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms