Protein–RNA interactions for Protein: P48449

LSS, Lanosterol synthase, humanhuman

Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSSP48449 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.27
LSSP48449 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSSP48449 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSSP48449 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSSP48449 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LSSP48449 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSSP48449 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSSP48449 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LSSP48449 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSSP48449 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LSSP48449 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LSSP48449 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LSSP48449 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSSP48449 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSSP48449 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
LSSP48449 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LSSP48449 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LSSP48449 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
LSSP48449 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSSP48449 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSSP48449 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSSP48449 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LSSP48449 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
LSSP48449 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSSP48449 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSSP48449 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LSSP48449 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LSSP48449 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LSSP48449 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
LSSP48449 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LSSP48449 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LSSP48449 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
LSSP48449 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms