Protein–RNA interactions for Protein: P48378

RFX2, DNA-binding protein RFX2, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX2P48378 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFX2P48378 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RFX2P48378 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFX2P48378 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFX2P48378 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFX2P48378 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RFX2P48378 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RFX2P48378 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RFX2P48378 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFX2P48378 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFX2P48378 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFX2P48378 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFX2P48378 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RFX2P48378 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RFX2P48378 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFX2P48378 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFX2P48378 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFX2P48378 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFX2P48378 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFX2P48378 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RFX2P48378 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFX2P48378 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFX2P48378 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RFX2P48378 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFX2P48378 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFX2P48378 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFX2P48378 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RFX2P48378 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RFX2P48378 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFX2P48378 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFX2P48378 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFX2P48378 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFX2P48378 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFX2P48378 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RFX2P48378 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
RFX2P48378 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RFX2P48378 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFX2P48378 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFX2P48378 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
RFX2P48378 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFX2P48378 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFX2P48378 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RFX2P48378 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms