Protein–RNA interactions for Protein: P47821

SSN8, RNA polymerase II holoenzyme cyclin-like subunit, yeastyeast

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSN8P47821 YIR042CYIR042C 711 nt5.3□□□□□ -1.56
SSN8P47821 SRN2YLR119W 642 nt5.3□□□□□ -1.56
SSN8P47821 SEC17YBL050W 879 nt5.3□□□□□ -1.56
SSN8P47821 MCH1YDL054C 1461 nt5.3□□□□□ -1.56
SSN8P47821 SIR2YDL042C 1689 nt5.3□□□□□ -1.56
SSN8P47821 ASK10YGR097W 3441 nt5.3□□□□□ -1.56
SSN8P47821 AIM17YHL021C 1398 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 OSW2YLR054C 2175 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 TEP1YNL128W 1305 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 YNL247WYNL247W 2304 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 CDC10YCR002C 969 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 ERP5YHR110W 639 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 YHR140WYHR140W 720 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 YMR122CYMR122C 375 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 YOL163WYOL163W 510 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 ATP1YBL099W 1638 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 DFG5YMR238W 1377 nt5.29□□□□□ -1.56
SSN8P47821 CDC1YDR182W 1476 nt5.28□□□□□ -1.56
SSN8P47821 TUP1YCR084C 2142 nt5.28□□□□□ -1.56
SSN8P47821 CTR2YHR175W 570 nt5.28□□□□□ -1.56
SSN8P47821 RPE1YJL121C 717 nt5.28□□□□□ -1.56
SSN8P47821 PDB1YBR221C 1101 nt5.28□□□□□ -1.56
SSN8P47821 CRF1YDR223W 1404 nt5.28□□□□□ -1.56
SSN8P47821 RVB2YPL235W 1416 nt5.28□□□□□ -1.56
SSN8P47821 YMR155WYMR155W 1644 nt5.27□□□□□ -1.57
SSN8P47821 UTP18YJL069C 1785 nt5.27□□□□□ -1.57
SSN8P47821 OPI7YDR360W 435 nt5.27□□□□□ -1.57
SSN8P47821 VMA4YOR332W 702 nt5.27□□□□□ -1.57
SSN8P47821 DAP1YPL170W 459 nt5.27□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YPR196WYPR196W 1413 nt5.27□□□□□ -1.57
SSN8P47821 NOC4YPR144C 1659 nt5.27□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YCK1YHR135C 1617 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 PET112YBL080C 1626 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 NHA1YLR138W 2958 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 SEC18YBR080C 2277 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 CHO1YER026C 831 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 ECM14YHR132C 1293 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 TDH2YJR009C 999 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 VPS24YKL041W 675 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YJU2YKL095W 837 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 SPG4YMR107W 348 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 ASH1YKL185W 1767 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YTP1YNL237W 1380 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 SIA1YOR137C 1869 nt5.26□□□□□ -1.57
SSN8P47821 PDC1YLR044C 1692 nt5.25□□□□□ -1.57
SSN8P47821 ADE13YLR359W 1449 nt5.25□□□□□ -1.57
SSN8P47821 PMP3YDR276C 168 nt5.25□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YPL062WYPL062W 405 nt5.25□□□□□ -1.57
SSN8P47821 GLN1YPR035W 1113 nt5.25□□□□□ -1.57
SSN8P47821 NOP7YGR103W 1818 nt5.25□□□□□ -1.57
SSN8P47821 PHO90YJL198W 2646 nt5.25□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YIL067CYIL067C 2037 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 RPT2YDL007W 1314 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 ADE6YGR061C 4077 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 AVO1YOL078W 3531 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YFR035CYFR035C 345 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 ECT1YGR007W 972 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 MDH1YKL085W 1005 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 TAF11YML015C 1041 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 RRS1YOR294W 612 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 HOS2YGL194C 1359 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 GUA1YMR217W 1578 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 BPL1YDL141W 2073 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 DPB2YPR175W 2070 nt5.24□□□□□ -1.57
SSN8P47821 WTM2YOR229W 1404 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 GRS1YBR121C 2004 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 MSP1YGR028W 1089 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 BCY1YIL033C 1251 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 DRE2YKR071C 1047 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YKR073CYKR073C 321 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YMR119W-AYMR119W-A 375 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YMR147WYMR147W 672 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YNR048WYNR048W 1182 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YOL131WYOL131W 327 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 IFA38YBR159W 1044 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 WHI2YOR043W 1461 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 TOS3YGL179C 1683 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YTA6YPL074W 2265 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 FET3YMR058W 1911 nt5.23□□□□□ -1.57
SSN8P47821 ARN2YHL047C 1863 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 PRP40YKL012W 1752 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 GUD1YDL238C 1470 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YDL121CYDL121C 450 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YDR053WYDR053W 396 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 LDS1YAL018C 978 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 YPL136WYPL136W 369 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 TUL1YKL034W 2277 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 AFT1YGL071W 2073 nt5.22□□□□□ -1.57
SSN8P47821 NRD1YNL251C 1728 nt5.21□□□□□ -1.58
SSN8P47821 YET3YDL072C 612 nt5.21□□□□□ -1.58
SSN8P47821 RPT3YDR394W 1287 nt5.21□□□□□ -1.58
SSN8P47821 CAX4YGR036C 720 nt5.21□□□□□ -1.58
SSN8P47821 ARP1YHR129C 1155 nt5.21□□□□□ -1.58
SSN8P47821 TSA1YML028W 591 nt5.21□□□□□ -1.58
SSN8P47821 ECM7YLR443W 1347 nt5.21□□□□□ -1.58
SSN8P47821 MAK31YCR020C-A 267 nt5.2□□□□□ -1.58
SSN8P47821 RPL10YLR075W 666 nt5.2□□□□□ -1.58
SSN8P47821 YML131WYML131W 1098 nt5.2□□□□□ -1.58
SSN8P47821 DOM34YNL001W 1161 nt5.2□□□□□ -1.58
SSN8P47821 AST1YBL069W 1290 nt5.2□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 12.3 ms