Protein–RNA interactions for Protein: P47710

CSN1S1, Alpha-S1-casein, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSN1S1P47710 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CSN1S1P47710 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
CSN1S1P47710 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms