Protein–RNA interactions for Protein: P46934

NEDD4, E3 ubiquitin-protein ligase NEDD4, humanhuman

Predictions only

Length 1,319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD4P46934 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
NEDD4P46934 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NEDD4P46934 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NEDD4P46934 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms