Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDKN1BP46527 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CDKN1BP46527 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CDKN1BP46527 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.3 ms