Protein–RNA interactions for Protein: P46459

NSF, Vesicle-fusing ATPase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSFP46459 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSFP46459 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSFP46459 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSFP46459 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSFP46459 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NSFP46459 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSFP46459 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSFP46459 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSFP46459 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NSFP46459 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSFP46459 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NSFP46459 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NSFP46459 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NSFP46459 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSFP46459 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NSFP46459 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSFP46459 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSFP46459 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
NSFP46459 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSFP46459 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NSFP46459 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSFP46459 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSFP46459 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
NSFP46459 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSFP46459 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
NSFP46459 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSFP46459 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
NSFP46459 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
NSFP46459 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSFP46459 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
NSFP46459 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSFP46459 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSFP46459 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
NSFP46459 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
NSFP46459 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSFP46459 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSFP46459 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NSFP46459 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
NSFP46459 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSFP46459 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSFP46459 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
NSFP46459 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
NSFP46459 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
NSFP46459 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSFP46459 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSFP46459 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSFP46459 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSFP46459 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSFP46459 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
NSFP46459 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
NSFP46459 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
NSFP46459 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSFP46459 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSFP46459 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSFP46459 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
NSFP46459 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSFP46459 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
NSFP46459 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSFP46459 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSFP46459 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSFP46459 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSFP46459 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSFP46459 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSFP46459 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
NSFP46459 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms