Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PIK3CBP42338 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PIK3CBP42338 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PIK3CBP42338 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PIK3CBP42338 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.2 ms