Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRIA2P42262 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRIA2P42262 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA2P42262 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.1 ms