Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 SNU71YGR013W 1863 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 YEA6YEL006W 1008 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 YKL223WYKL223W 333 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 POR1YNL055C 852 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 YPR098CYPR098C 486 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 TRP3YKL211C 1455 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 SAC6YDR129C 1929 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 BRL1YHR036W 1416 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 BUD9YGR041W 1644 nt6.07□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 BUL1YMR275C 2931 nt6.06□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 RSC2YLR357W 2670 nt6.06□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 RPR2YIR015W 435 nt6.06□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 RPS15YOL040C 429 nt6.06□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 ORC5YNL261W 1440 nt6.06□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 EMW1YNL313C 2715 nt6.05□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 RIM101YHL027W 1878 nt6.05□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 IDP3YNL009W 1263 nt6.05□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 MRPL22YNL177C 930 nt6.05□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 SSP120YLR250W 705 nt6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 SEC12YNR026C 1416 nt6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 PDH1YPR002W 1551 nt6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 BAP2YBR068C 1830 nt6.04□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 YRA1YDR381W 681 nt6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 HCR1YLR192C 798 nt6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 MKK2YPL140C 1521 nt6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 PAP2YOL115W 1755 nt6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 PIF1YML061C 2580 nt6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 PCS60YBR222C 1632 nt6.03□□□□□ -1.44
SHQ1P40486 CLP1YOR250C 1338 nt6.02□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 YCL065WYCL065W 369 nt6.02□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 RHB1YCR027C 630 nt6.02□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 PAN6YIL145C 930 nt6.02□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 RFA1YAR007C 1866 nt6.02□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 MAK32YCR019W 1092 nt6.01□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 VCX1YDL128W 1236 nt6.01□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 YIL060WYIL060W 435 nt6.01□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 HSP150YJL159W 1242 nt6.01□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 IME2YJL106W 1938 nt6□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 HEM3YDL205C 984 nt6□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 YGR022CYGR022C 330 nt6□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 PGA2YNL149C 390 nt6□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 GPT2YKR067W 2232 nt6□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 TFC6YDR362C 2019 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 SKN1YGR143W 2316 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 OPT1YJL212C 2400 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 YCR047W-AYCR047W-A 207 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 HOR7YMR251W-A 180 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 MTQ1YNL063W 945 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 YNR075C-AYNR075C-A 93 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 HXT3YDR345C 1704 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 SCT1YBL011W 2280 nt5.99□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 SHM1YBR263W 1473 nt5.98□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 YDR053WYDR053W 396 nt5.98□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 YBL044WYBL044W 369 nt5.98□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 HPF1YOL155C 2904 nt5.98□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 SUB2YDL084W 1341 nt5.98□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 TRK2YKR050W 2670 nt5.97□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 ACF2YLR144C 2340 nt5.97□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 ACC1YNR016C 6702 nt5.97□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 TEF1YPR080W 1377 nt5.96□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 TEF2YBR118W 1377 nt5.96□□□□□ -1.45
SHQ1P40486 UTP18YJL069C 1785 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 VTH1YIL173W 4650 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 VTH2YJL222W 4650 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 TFB4YPR056W 1017 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 DUG1YFR044C 1446 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 TRP5YGL026C 2124 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 QNS1YHR074W 2145 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 HFI1YPL254W 1467 nt5.96□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 IMA2YOL157C 1770 nt5.95□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 UGO1YDR470C 1509 nt5.95□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 UTP7YER082C 1665 nt5.95□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 MTQ2YDR140W 666 nt5.95□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 MRP17YKL003C 396 nt5.95□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 ELA1YNL230C 1140 nt5.95□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 SHE10YGL228W 1734 nt5.94□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 ASN1YPR145W 1719 nt5.94□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 CWC21YDR482C 408 nt5.94□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 PDC1YLR044C 1692 nt5.94□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 YKL031WYKL031W 414 nt5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 PGA3YML125C 939 nt5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 RDL2YOR286W 450 nt5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 CWC27YPL064C 906 nt5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 MRPL36YBR122C 534 nt5.93□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 YDL023CYDL023C 321 nt5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 GIR2YDR152W 798 nt5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 YDR154CYDR154C 351 nt5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 GLO2YDR272W 825 nt5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 YNR048WYNR048W 1182 nt5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 RAT1YOR048C 3021 nt5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 TEL2YGR099W 2067 nt5.92□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 CDC43YGL155W 1131 nt5.91□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 MND2YIR025W 1107 nt5.91□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 ARR3YPR201W 1215 nt5.91□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 LSG1YGL099W 1923 nt5.91□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 CHL4YDR254W 1377 nt5.91□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 YPL277CYPL277C 1464 nt5.9□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 NQM1YGR043C 1002 nt5.9□□□□□ -1.46
SHQ1P40486 SRP101YDR292C 1866 nt5.9□□□□□ -1.47
SHQ1P40486 VTC2YFL004W 2487 nt5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15.5 ms