Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
THPOP40225 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
THPOP40225 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THPOP40225 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
THPOP40225 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
THPOP40225 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THPOP40225 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
THPOP40225 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
THPOP40225 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THPOP40225 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THPOP40225 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
THPOP40225 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
THPOP40225 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
THPOP40225 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
THPOP40225 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THPOP40225 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.01■■□□□ 1.75
THPOP40225 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
THPOP40225 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
THPOP40225 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THPOP40225 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
THPOP40225 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THPOP40225 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
THPOP40225 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
THPOP40225 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THPOP40225 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THPOP40225 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THPOP40225 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THPOP40225 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THPOP40225 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
THPOP40225 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THPOP40225 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THPOP40225 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THPOP40225 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THPOP40225 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THPOP40225 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
THPOP40225 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
THPOP40225 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
THPOP40225 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THPOP40225 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THPOP40225 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THPOP40225 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC25.96■■□□□ 1.75
THPOP40225 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
THPOP40225 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
THPOP40225 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THPOP40225 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
THPOP40225 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms