Protein–RNA interactions for Protein: P40087

DDI1, DNA damage-inducible protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1P40087 ERG1YGR175C 1491 nt5.32□□□□□ -1.56
DDI1P40087 SRP101YDR292C 1866 nt5.32□□□□□ -1.56
DDI1P40087 SOH1YGL127C 384 nt5.32□□□□□ -1.56
DDI1P40087 NCS6YGL211W 1080 nt5.32□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YNL165WYNL165W 1221 nt5.32□□□□□ -1.56
DDI1P40087 MCX1YBR227C 1563 nt5.32□□□□□ -1.56
DDI1P40087 BUD14YAR014C 2130 nt5.32□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YKL031WYKL031W 414 nt5.31□□□□□ -1.56
DDI1P40087 VPS24YKL041W 675 nt5.31□□□□□ -1.56
DDI1P40087 MDY2YOL111C 639 nt5.31□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YPR098CYPR098C 486 nt5.31□□□□□ -1.56
DDI1P40087 CYK3YDL117W 2658 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 ATG7YHR171W 1893 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 BNA5YLR231C 1362 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 SET5YHR207C 1581 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 OPI7YDR360W 435 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 PRS1YKL181W 1284 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YLR184WYLR184W 348 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YML012C-AYML012C-A 378 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YMR122CYMR122C 375 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 PGA2YNL149C 390 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 MLC2YPR188C 492 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 FRE3YOR381W 2136 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 PDC1YLR044C 1692 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 UTP4YDR324C 2331 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 VMS1YDR049W 1899 nt5.3□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YDR109CYDR109C 2148 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 DRS1YLL008W 2259 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 SIA1YOR137C 1869 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YDR187CYDR187C 519 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YER010CYER010C 705 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 GAL83YER027C 1254 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 TSR3YOR006C 942 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 DDC1YPL194W 1839 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 APE3YBR286W 1614 nt5.29□□□□□ -1.56
DDI1P40087 PMT2YAL023C 2280 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 SIT1YEL065W 1887 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YML082WYML082W 1950 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YDR015CYDR015C 240 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 ORM1YGR038W 669 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 FHN1YGR131W 525 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YNL019CYNL019C 855 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YNL033WYNL033W 855 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 PDH1YPR002W 1551 nt5.28□□□□□ -1.56
DDI1P40087 YMR295CYMR295C 594 nt5.27□□□□□ -1.57
DDI1P40087 SCS22YBL091C-A 528 nt5.27□□□□□ -1.57
DDI1P40087 COX11YPL132W 903 nt5.27□□□□□ -1.57
DDI1P40087 IES1YFL013C 2079 nt5.27□□□□□ -1.57
DDI1P40087 DPH2YKL191W 1605 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 RPT2YDL007W 1314 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 PMP3YDR276C 168 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 SEC20YDR498C 1152 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YEL077CYEL077C 3834 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 HCR1YLR192C 798 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 ECM33YBR078W 1290 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 RAD53YPL153C 2466 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 SSZ1YHR064C 1617 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 ELP2YGR200C 2367 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 UTP9YHR196W 1728 nt5.26□□□□□ -1.57
DDI1P40087 DBP8YHR169W 1296 nt5.25□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YKR041WYKR041W 753 nt5.25□□□□□ -1.57
DDI1P40087 SPG4YMR107W 348 nt5.25□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt5.25□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YNL108CYNL108C 813 nt5.25□□□□□ -1.57
DDI1P40087 MRPL10YNL284C 969 nt5.25□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YMR155WYMR155W 1644 nt5.25□□□□□ -1.57
DDI1P40087 SEC12YNR026C 1416 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 TAH18YPR048W 1872 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 NRD1YNL251C 1728 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 SEC18YBR080C 2277 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 PHM8YER037W 966 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 LEU5YHR002W 1074 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 MDH1YKL085W 1005 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 NRM1YNR009W 750 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 HAP1YLR256W 4509 nt5.24□□□□□ -1.57
DDI1P40087 ARO10YDR380W 1908 nt5.23□□□□□ -1.57
DDI1P40087 RHO3YIL118W 696 nt5.23□□□□□ -1.57
DDI1P40087 CIN4YMR138W 576 nt5.23□□□□□ -1.57
DDI1P40087 JNM1YMR294W 1122 nt5.23□□□□□ -1.57
DDI1P40087 RPS15YOL040C 429 nt5.23□□□□□ -1.57
DDI1P40087 UTP18YJL069C 1785 nt5.23□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YDL129WYDL129W 876 nt5.22□□□□□ -1.57
DDI1P40087 GLO2YDR272W 825 nt5.22□□□□□ -1.57
DDI1P40087 CDC43YGL155W 1131 nt5.22□□□□□ -1.57
DDI1P40087 YGR176WYGR176W 348 nt5.22□□□□□ -1.57
DDI1P40087 VPS72YDR485C 2388 nt5.22□□□□□ -1.57
DDI1P40087 DUR1,2YBR208C 5508 nt5.21□□□□□ -1.58
DDI1P40087 MRF1YGL143C 1242 nt5.21□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YHR213W-AYHR213W-A 234 nt5.21□□□□□ -1.58
DDI1P40087 BAP2YBR068C 1830 nt5.2□□□□□ -1.58
DDI1P40087 SOG2YOR353C 2376 nt5.2□□□□□ -1.58
DDI1P40087 ATO3YDR384C 828 nt5.2□□□□□ -1.58
DDI1P40087 HVG1YER039C 750 nt5.2□□□□□ -1.58
DDI1P40087 NQM1YGR043C 1002 nt5.2□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YNL285WYNL285W 372 nt5.2□□□□□ -1.58
DDI1P40087 SNT2YGL131C 4212 nt5.2□□□□□ -1.58
DDI1P40087 NTH2YBR001C 2343 nt5.19□□□□□ -1.58
DDI1P40087 YDL121CYDL121C 450 nt5.19□□□□□ -1.58
DDI1P40087 TFG2YGR005C 1203 nt5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11 ms