Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TRIM23P36406 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TRIM23P36406 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TRIM23P36406 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms