Protein–RNA interactions for Protein: P35251

RFC1, Replication factor C subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFC1P35251 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RFC1P35251 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC1P35251 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC1P35251 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC1P35251 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC1P35251 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RFC1P35251 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC1P35251 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC1P35251 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC1P35251 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC1P35251 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC1P35251 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC1P35251 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RFC1P35251 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
RFC1P35251 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC1P35251 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC1P35251 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC1P35251 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC1P35251 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC1P35251 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RFC1P35251 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFC1P35251 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFC1P35251 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFC1P35251 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFC1P35251 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RFC1P35251 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFC1P35251 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFC1P35251 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFC1P35251 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFC1P35251 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFC1P35251 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RFC1P35251 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RFC1P35251 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC1P35251 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC1P35251 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC1P35251 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC1P35251 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RFC1P35251 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC1P35251 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC1P35251 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC1P35251 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC1P35251 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC1P35251 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
RFC1P35251 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC1P35251 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC1P35251 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC1P35251 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC1P35251 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC1P35251 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC1P35251 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RFC1P35251 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC1P35251 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC1P35251 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC1P35251 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC1P35251 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RFC1P35251 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RFC1P35251 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC1P35251 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC1P35251 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC1P35251 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RFC1P35251 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RFC1P35251 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFC1P35251 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RFC1P35251 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFC1P35251 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
RFC1P35251 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFC1P35251 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
RFC1P35251 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFC1P35251 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFC1P35251 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFC1P35251 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RFC1P35251 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms