Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SFTPDP35247 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPDP35247 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPDP35247 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPDP35247 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPDP35247 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPDP35247 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SFTPDP35247 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPDP35247 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPDP35247 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPDP35247 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SFTPDP35247 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPDP35247 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPDP35247 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SFTPDP35247 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPDP35247 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPDP35247 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPDP35247 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPDP35247 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPDP35247 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPDP35247 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SFTPDP35247 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SFTPDP35247 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SFTPDP35247 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFTPDP35247 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFTPDP35247 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SFTPDP35247 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFTPDP35247 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFTPDP35247 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SFTPDP35247 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SFTPDP35247 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFTPDP35247 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SFTPDP35247 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SFTPDP35247 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SFTPDP35247 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SFTPDP35247 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 120.8 ms