Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CXCR5P32302 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CXCR5P32302 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CXCR5P32302 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CXCR5P32302 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms