Protein–RNA interactions for Protein: P31431

SDC4, Syndecan-4, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC4P31431 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SDC4P31431 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SDC4P31431 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDC4P31431 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SDC4P31431 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDC4P31431 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDC4P31431 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDC4P31431 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDC4P31431 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SDC4P31431 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SDC4P31431 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDC4P31431 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDC4P31431 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDC4P31431 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDC4P31431 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDC4P31431 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SDC4P31431 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDC4P31431 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDC4P31431 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDC4P31431 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SDC4P31431 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDC4P31431 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDC4P31431 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDC4P31431 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDC4P31431 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDC4P31431 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDC4P31431 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SDC4P31431 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SDC4P31431 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDC4P31431 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDC4P31431 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDC4P31431 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SDC4P31431 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDC4P31431 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDC4P31431 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDC4P31431 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SDC4P31431 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SDC4P31431 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDC4P31431 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDC4P31431 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDC4P31431 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDC4P31431 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDC4P31431 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDC4P31431 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SDC4P31431 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SDC4P31431 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SDC4P31431 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDC4P31431 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SDC4P31431 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SDC4P31431 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SDC4P31431 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDC4P31431 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDC4P31431 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SDC4P31431 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms