Protein–RNA interactions for Protein: P31271

HOXA13, Homeobox protein Hox-A13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA13P31271 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
HOXA13P31271 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HOXA13P31271 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HOXA13P31271 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms