Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC37.92■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.91■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC37.91■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.9■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC37.9■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.89■■■■□ 3.66
CLIP1P30622 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC37.88■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC37.87■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC37.87■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC37.86■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.86■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.85■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC37.83■■■■□ 3.65
CLIP1P30622 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC37.81■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC37.8■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.79■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.77■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
CLIP1P30622 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.76■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC37.74■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.72■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC37.71■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.71■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.7■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
CLIP1P30622 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC37.7■■■■□ 3.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms