Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EPHB2P29323 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EPHB2P29323 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EPHB2P29323 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPHB2P29323 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms