Protein–RNA interactions for Protein: P28328

PEX2, Peroxisome biogenesis factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX2P28328 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX2P28328 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PEX2P28328 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX2P28328 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX2P28328 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX2P28328 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX2P28328 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PEX2P28328 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX2P28328 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PEX2P28328 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PEX2P28328 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX2P28328 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX2P28328 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX2P28328 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX2P28328 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX2P28328 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX2P28328 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PEX2P28328 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PEX2P28328 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX2P28328 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX2P28328 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PEX2P28328 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PEX2P28328 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX2P28328 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX2P28328 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX2P28328 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX2P28328 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX2P28328 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX2P28328 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PEX2P28328 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX2P28328 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PEX2P28328 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX2P28328 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX2P28328 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX2P28328 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX2P28328 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PEX2P28328 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PEX2P28328 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PEX2P28328 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX2P28328 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX2P28328 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX2P28328 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX2P28328 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX2P28328 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PEX2P28328 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX2P28328 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX2P28328 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX2P28328 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX2P28328 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX2P28328 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PEX2P28328 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms