Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
HTR1BP28222 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HTR1BP28222 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HTR1BP28222 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms