Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HLA-DMAP28067 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
HLA-DMAP28067 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
HLA-DMAP28067 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms