Protein–RNA interactions for Protein: P28065

PSMB9, Proteasome subunit beta type-9, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB9P28065 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PSMB9P28065 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1
PSMB9P28065 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PSMB9P28065 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB9P28065 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB9P28065 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB9P28065 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB9P28065 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB9P28065 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
PSMB9P28065 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMB9P28065 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMB9P28065 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMB9P28065 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMB9P28065 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMB9P28065 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms