Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CHMP24386 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CHMP24386 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP24386 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP24386 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP24386 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP24386 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP24386 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CHMP24386 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CHMP24386 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CHMP24386 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP24386 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP24386 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP24386 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP24386 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP24386 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP24386 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CHMP24386 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CHMP24386 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP24386 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP24386 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP24386 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP24386 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP24386 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CHMP24386 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CHMP24386 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP24386 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP24386 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP24386 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP24386 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP24386 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP24386 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CHMP24386 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CHMP24386 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP24386 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP24386 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP24386 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP24386 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP24386 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP24386 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CHMP24386 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP24386 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP24386 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP24386 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP24386 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CHMP24386 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms