Protein–RNA interactions for Protein: P23588

EIF4B, Eukaryotic translation initiation factor 4B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF4BP23588 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EIF4BP23588 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EIF4BP23588 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EIF4BP23588 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms