Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
AMPD1P23109 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
AMPD1P23109 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms