Protein–RNA interactions for Protein: P22492

HIST1H1T, Histone H1t, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1TP22492 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
HIST1H1TP22492 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HIST1H1TP22492 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HIST1H1TP22492 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms