Protein–RNA interactions for Protein: P20963

CD247, T-cell surface glycoprotein CD3 zeta chain, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD247P20963 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CD247P20963 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CD247P20963 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CD247P20963 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CD247P20963 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CD247P20963 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CD247P20963 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD247P20963 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD247P20963 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CD247P20963 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD247P20963 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD247P20963 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD247P20963 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CD247P20963 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD247P20963 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CD247P20963 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD247P20963 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD247P20963 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CD247P20963 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CD247P20963 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CD247P20963 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD247P20963 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD247P20963 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CD247P20963 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CD247P20963 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms