Protein–RNA interactions for Protein: P20783

NTF3, Neurotrophin-3, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTF3P20783 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF3P20783 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
NTF3P20783 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NTF3P20783 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
NTF3P20783 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF3P20783 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF3P20783 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
NTF3P20783 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NTF3P20783 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NTF3P20783 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NTF3P20783 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NTF3P20783 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NTF3P20783 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
NTF3P20783 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTF3P20783 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
NTF3P20783 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms