Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP4AP20648 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ATP4AP20648 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ATP4AP20648 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ATP4AP20648 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms